iPadに動画ファイルを転送して再生するためには、iTunesが必要です。GOM Encoderで作成したMP4動画ファイルをiTunesに転送(登録)し、iTunesを使ってiPad本体に動画ファイルを送るようになります。変換を始める前にiPadをパソコンに接続してください。

→動画変換がスタートすると変換プレビュー画面が表示され設定できます。

iTunesの[ライブラリ]-[ムービー]をクリックすると追加されたMP4動画を確認できます。またこのとき、[デバイス]にiPadが表示され、iPadが正常に認識されていることを確認します。
※これは手動で同期を行う設定の場合の例です。
自動同期の設定の場合は接続と同時に動画がiPadへ転送されます。